Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms