Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U6N9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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