Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kdm4dQ3U2K5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Kdm4dQ3U2K5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Kdm4dQ3U2K5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Kdm4dQ3U2K5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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