Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf149Q3U2C5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnf149Q3U2C5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf149Q3U2C5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf149Q3U2C5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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