Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms