Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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