Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms