Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms