Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms