Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Shroom4Q1W617 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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