Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rpusd3Q14AI6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms