Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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VgfQ0VGU4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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VgfQ0VGU4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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VgfQ0VGU4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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VgfQ0VGU4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VgfQ0VGU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VgfQ0VGU4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms