Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col19a1Q0VF58 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms