Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc1Q0VDN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms