Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms