Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab42Q0PD08 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms