Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MitfQ08874 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms