Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnma1Q08460 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms