Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms