Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms