Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox10Q04888 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms