Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms