Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms