Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb5Q02739 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms