Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Muc1Q02496 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms