Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai1Q02085 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms