Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms