Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms