Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col1a2Q01149 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms