Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms