Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms