Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms