Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms