Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms