Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Taf1bP97358 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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