Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3aP97351 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3aP97351 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms