Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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