Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irx2P81066 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irx2P81066 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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