Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiitaP79621 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiitaP79621 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms