Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tp53bp1P70399 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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