Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Usp9xP70398 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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