Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms