Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Acta1P68134 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Acta1P68134 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Acta1P68134 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Acta1P68134 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Acta1P68134 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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