Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gnb1P62874 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms