Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms