Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms