Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms