Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms