Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms