Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sssca1P56873 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sssca1P56873 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms